Микробиом — «недооценённый и необходимый»

Компании, занятые разработкой лекарственных средств и методов лечения на основе микробиом, видят большой потенциал этого направления в будущем. Корреспондент британского издания Pharmaphorum Бен Харгривз побеседовал с разработчиками терапии на основе микробиом о перспективах лечения желудочно-кишечных, онкологических, неврологических и других заболеваний. Приводим перевод статьи. 

За последнее десятилетие интерес к изучению влияния микробиом на здоровье значительно вырос. Если в 2011 году научная база PubMed цитировала всего 1822 исследования микробиом, в 2021 году - уже 25153. Дополнительные исследования показали более тесные и неожиданные связи между микробиотой кишечника и другими органами, и системами организма, например, здоровьем мозга и иммунной системой. Микробиота носовой, ротовой, кожной, желудочно-кишечной и мочеполовой областей, содержит различные микробные сообщества, влияющие на здоровье всего организма.

Исследования микробиом стали возможными благодаря технологическому прогрессу. Например, масштабное секвенирование генов позволяет исследователям проводить метагеномный анализ и получать подробные генетические данные микробиоты.

По мере роста публикаций результатов этих исследований становился понятен их коммерческий потенциал. Это привело к активному росту рынка продуктов питания с пребиотиками, пробиотиками и постбиотиками. Не осталась в стороне и фармацевтическая промышленность. Фармацевтические гиганты Merck, Gilead, Genentech, Johnson & Johnson и Takeda в коллаборации с небольшими исследовательскими биотехнологическими компаниями уже включились в разработку новых лекарственных средств на основе микробиом —  фармабиотиков.

Возможности микробиом

Кишечник содержит около одного триллиона микробов и не менее 160 видов бактерий, которые постоянно взаимодействуют друг с другом и с клеточной оболочкой. Кишечную микробиоту уже давно связывают с различными желудочно-кишечными заболеваниями и заболеваниями обмена веществ: воспалениями, синдромом раздраженного кишечника, ожирением и диабетом 2 типа. Недавние исследования показали связь микробиоты со здоровьем сердца и мозга через так называемую кишечно-мозговую ось.

Задача фармацевтических и биотехнологических компаний – разработать лекарства в тех терапевтических областях, где сосредоточено максимальное количество потенциальных показаний. Биотехнологическая компания Seres Therapeutics, специализирующаяся в области микробиом, разработала лекарственный кандидат, наиболее близкий к выходу на рынок. SER-109 нацелен на терапию пациентов с рецидивирующей Clostridium difficile -ассоциированной инфекцией (CDI).

Разработка получила статус прорывной терапии и орфанного препарата FDA США по результатам достижения первичных контрольных точек в ходе клинического исследования III фазы. Препарат продемонстрировал статистически значимое абсолютное снижение частоты рецидивов CDI на 30,2% по сравнению с плацебо. Генеральный директор компании Эрик Шафф говорит: «Наш кандидат SER-109 подтвердил возможность широкого применения для защиты от инфекций различных групп пациентов». Таким образом, кандидат Seres может стать первым фармабиотиком, одобренным FDA.

В середине прошлого года швейцарский гигант Nestlé подтвердил участие в данном проекте, заплатив Seres авансом 175 миллионов долларов за права совместного маркетинга препарата в Северной Америке. Seres Therapeutics имеет шанс получить от глобального производителя дополнительно 125 миллионов долларов после полного одобрения препарата FDA и еще 225 миллионов долларов на этапе коммерциализации.

Шафф заявил о дальнейших планах компании: «По результатам текущего исследования SER-109, мы сфокусировались на терапии инфекционных бактериальных заболеваний, отягощённых множественной лекарственной устойчивостью для защиты пациентов с несколькими факторами риска».

Глаза шире живота

Несмотря на то, что методы лечения на основе микробиом сегодня в основном направлены на желудочно-кишечные заболевания, потенциал их применения гораздо шире. Finch Therapeutics совместно с Takeda разрабатывает несколько препаратов для лечения расстройств аутистического спектра (РАС). Компания заявляет, что у части людей с этим заболеванием также наблюдаются наиболее распространенные желудочно-кишечные расстройства, и ожидается, что лечение может устранить как желудочно-кишечные, так и поведенческие симптомы, воздействуя на несколько путей, связанных с РАС.

В настоящее время растет число исследований, позволяющих предположить, что микробиом может влиять на реакцию на иммунотерапию. 4D Pharma, еще одна биотехнологическая компания с портфелем продуктов для лечения иммуноонкологических заболеваний и заболеваний центральной нервной системы, проводит клинические исследования MRx0518 - собственного лекарственного кандидата на основе микробиом. Первые полученные результаты показали, что он способен повышать ключевые иммунные биомаркеры противоракового иммунного ответа и улучшать клинические результаты пациентов.

Этого было достаточно, чтобы Pfizer и Merck решили сотрудничать с 4D для клинических испытаний их иммунотерапевтических препаратов авелумаба и пембролизумаба в комбинации с фармабиотиком. В ближайшее время начнутся испытания обоих препаратов вместе с кандидатом MRx0518.

Убедительные преимущества

Представитель 4D Pharma объяснил, что терапия на основе микробиом или живые биотерапевтические продукты (LBP) в комбинации с основной терапией обладают огромным терапевтическим потенциалом, в первую очередь, благодаря высокому профилю безопасности.

«Мы ожидаем, что встречающиеся в природе штаммы комменсальных бактерий человека, первоначально выделенных от здоровых людей-доноров, будут иметь очень чистые профили безопасности», — сказал он. «Это также означает, что LBP подходят в качестве комбинированной терапии, обеспечивая более высокую эффективность без дополнительных проблем с токсичностью».

Помимо этого, LBP могут выйти за рамки терапевтических возможностей традиционных малых молекул или биологических препаратов. Это связано с их способностью поражать несколько целей одним и тем же препаратом, что, наряду с ожидаемым профилем безопасности лечения, может дать преимущества по сравнению с существующими методами лечения.

«В более широком смысле микробиом можно рассматривать как аналог критически важного органа, который мы ранее упускали из виду или недооценивали, но который участвует в правильном функционировании широкого спектра систем человека, от метаболизма до иммунологии (включая иммуноонкологию) и неврологии через ось кишечник-мозг. Таким образом, микробиом предлагает совершенно новые возможности для лечения множества различных заболеваний», — заключил представитель 4D Pharma.

Справка: Микробиом (от древнегреческого μικρός (mikrós) "маленький" и βίος (биос) "жизнь") - это сообщество микроорганизмов, которые обычно можно встретить, живущих вместе в любой данной среде обитания.